ブドウ球菌は、体のあらゆる部位に感染し異なる症状を呈します。膿瘍（膿のかたまり）をつくり易く、その範囲は皮膚だけでなく内臓にも及びます。感染症の症状は、軽度なものから生命の危険に及ぶものまで様々です。

　ブドウ球菌は皮膚に感染する傾向があり、多くの皮膚病を発症します。

　ブドウ球菌性肺炎は、慢性気管支炎や肺気腫などの慢性肺疾患がある人やインフルエンザに合併して起こる重い感染症です。

　高熱が出て呼吸が速くなったり呼吸困難となり、血痰混じりの咳がでます。肺に膿瘍をつくることもあります。

　ブドウ球菌が血流に侵入すると、心臓で心内膜炎を起こします。短期間で心臓弁を侵して心不全の危険が強くなります。最悪時には、呼吸が弱く苦しくなり死にいたります。

　ブドウ球菌が血流に侵入し骨にいたると骨髄炎を起こすことがあり、骨の痛みの他、悪寒と発熱があります。皮膚も赤く腫れ、近傍の関節には水が溜まります。

　このブドウ球菌性骨髄炎は小児に多くみられます。

　ブドウ球菌の中で毒素を産生するタイプは、ブドウ球菌性食中毒や毒素性ショック症候群を呈することがあります。

　重度の火傷にブドウ球菌が感染すると菌血症を起こします。高熱が続き、ショックを起こしたり、最悪死亡することもあります。