強い感染力のために感染は両眼に及ぶことが多いですが、症状は最初に症状が出た眼の方に強くでます。角膜にまで炎症が及ぶと、び慢性表層角膜症となり、異物感や痛みを伴います。

　また、新生児や乳幼児では角膜面に儀膜ができ、偽膜性結膜炎を起こし、細菌の混合感染による角膜穿孔を起こす危険性もあります。儀膜は結膜面上にできる灰白色の膜で、透明度が低下し混濁します。

　通常は、発病後2～3週間で治癒します。流行性角結膜炎の発症年齢は、1～5歳を中心とする幼児に多いですが、成人も含む全ての年齢層で発症します。年度により、D群の8型、19型、37型の血清型が流行します。

　尚、流行性角結膜炎は、略号および英語では、〔EKC：Epidemic Kerato Conjunctivitis〕と呼ばれます。

　充血し、涙目、瞼の腫れなどの症状がでます。また、目が開かないほど目やにが出たり、一時的に視力の低下も来たすことがあります。症状が重くなると、リンパ節が腫れて触ると痛みを伴うようになります。

　結膜炎の症状は、片眼から発症し、4～5日後にもう一方の目にも発症することが多いです。症状が治まるまでに約2～3週間かかります。

　透明な角膜に点状の小さな混濁が生じ、眼に痛みを感じ、眩しく感じたり、眼が霞んだりします。場合によっては、視力障害を感じることもあります。

　黒目の表面がすり剥ける角膜びらんとなり、目にゴロゴロした異物感を感じたり、眼痛がひどくなります。症状が数か月～数年に及ぶことさえもあります。